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但后人却不甘心，仍想从断简残篇里寻找出这位亡国太子的下落来。于是，这位太子的从前已不重要，这位太子的才能素质、十六岁前的所经所历也不重要。诸多人都把他的下落的寻找与猜测当成了研究这位太子的重头戏。
关于朱慈烺太子去向的记载共有六种说法：一说被李自成杀死，或是杀于永平或是杀于北京；二说被李自成挟持出北京西行；三说被明太监高起潜收留；四说被外祖父周奎送交清廷处死；五说出家于广东阴那山灵光寺；六说“不知所踪”。
明末清初的史学家谈迁编修明史，写到“崇祯太子时”，带了点苦恼地说道：“今太子无踪，史臣执笔，其何所适从？”
但从当时北京城形势分析可知，太子是不可能轻易逃出城去的。崇祯上吊于煤山前，李自成便将北京城围得水泄不通。城中人无一人可出入，即使是攻进北京城后，李自成也并未放弃对明朝廷官员们的围捕。况且，崇祯太子身边已无人可用，无兵可使。只靠他一人之力和两位柔弱的弟弟以及几位忠心的太监是难以成事的。于是，其被李自成活捉便可作理所当然之事。
据《石匮书后集·烈帝本纪》记载：（李攻进城后）内臣献太子，自成留之西宫，封为宋王，太子不为屈。
《石匮书后集·太子本纪》谈到：李自成攻破京城后，太子被俘获。见到李自成，李命其下跪，太子怒道：“我怎么可以向乱贼下跪？”李自成问道：“你朱家何以丧天下？”太子愤恨道：“不该用周延儒等奸臣。”李自成道：“你还算明白。”
太子凛然问李自成：“如何不杀我？”李自成道：“你无罪，我不妄杀。”太子道：“既然如此，你依我三件事。一不可惊我祖宗陵寝，二速以礼葬我父皇母后，三不可杀戮我百姓。”李自成答应了。
该年该月十三日，李自成与吴三桂战败逃出北京城，在路上，太子趁乱摆脱了李自成的魔爪。从大顺军中逃出后，可能是因为要寻找亲人，他回到了已经掌握在满族人手中的北京，找到了自己的外祖父周奎，寄居在周家。并和自己的姐姐，那个被崇祯帝砍掉一只胳膊的长平公主重逢。姐弟俩抱头痛哭，整日沉浸在悲伤之中，无意中惊动了邻里和巡捕，小人周奎便把自己的外孙子交给了当时的清摄政王多尔衮。
这消息一传出，“百姓闻先帝太子尚在，馈送牲牢礼币者甚众”。多尔衮有些坐不住了。对于他来讲，一位困于牢房的朱慈烺并不可怕，可怕的是架着一“太子”称号的朱慈烺。
对于他来讲，现在无论是杀是留都很麻烦。作为外来入侵者，他一方面为了收买人心，可以礼葬崇祯皇帝，可以善待所有不再抵抗的人；另一方面对于他们一统中原的障碍决不会手软。可明太子正好处在这两种态度的矛盾之中，若是留着他，明朝的忠臣义士就会心怀希望地打着他的旗号前赴后继。可如果杀了他，清廷精心炮制的“为明朝报君父之仇”的幌子就会不攻自破。
仁者可急中生智，奸诈之流也有临危之小聪明。多尔衮很快想出了一个一箭双雕的好主意，那就是——让人指出太子是假的，以“冒充太子”之罪将太子杀掉。
于是，一场“认证真伪太子”的闹剧上演了。首先是亲人指认，太子外公周奎和舅舅周绎，自然领会了摄政王的上级意图，一口咬定太子是假冒的，长平公主坚持说是真的，被周奎打了一个耳光后也不再说话。曾经是太子老师的原内阁大学士谢升也指出是假的。于是，太子是假便成立了。发到刑部后，主事钱凤览力争太子是真，立即被关讯问。不久，太子被杀，罪名是“冒充前朝太子罪”。也就是说，他死后连个太子之名都没有得到。
还有一种说法是，李自成攻下北京后，下令搜索太子，太监粟宗周将太子献出，李自成把太子囚于刘宗敏家里。后来卫士将太子放出，到了南明小朝廷——南京。清兵攻入南京后，太子又被献出而遇害。
无论是哪一种说法，都承认了太子的下落——在清廷刽子手的刀下做了亡命鬼。而过于悲情的说法却是，他死时并不是以前朝太子身份死掉的，只是以一个假扮太子的“平民”身份而被清廷斩于街市。
父亲崇祯（1）
中国历史上没有一个末代君王如崇祯那样被后世几乎推崇成神仙，因为他是自杀的，因为在他短短的十几年统治时期，给人的感觉是一直在尽力想改变明王朝的残局。
表面的历史给我们的感觉是，崇祯具备了我们心中“君王”的特质。他的勤于朝政在明朝后期的几个皇帝里是有名的。自明中期以后，皇帝怠政之风盛行，令天下臣民忧心。正德皇帝视国家政务为儿戏，今日出宫外，明天下苏杭，寻花问柳，自不待言。嘉靖帝和万历帝都在位四十余年，他们笃信道教，整日在宫中做斋醮，曾“连数年不上朝理事”。天启帝爱木匠活，把国家政务尽委于大宦官魏忠贤。崇祯帝则一反过去诸帝的怠政之风，“日理平台”，像开国皇帝朱元璋那样“忧勤不怠”。不仅如此，如果没有极为特殊的急务，臣下进谏也按时举行。
从这点来看，崇祯帝很合乎一个好皇帝的标准。这也正是人们所常称道之处。再加上他不好声色，所以不少人就认为他不应该是个“亡国之君”。
另外，崇祯帝平时生活比较节俭，一次在御座讲课时，崇祯帝里衣的袖口偶尔露到外面，“袖微损”，崇祯就悄悄地将破损的袖口往里边塞了塞。一个讲官看到了，便奏道：“衣之敝虽过于位，然美德也，何必讳？”
最后，他铲除了魏忠贤这个大太监，为百姓与官员除了一害，此举使天下人心大快。无论当时还是后世，这件事都是崇祯帝最可称道之处。
在他死后，受到了士大夫、对手及史家等各方的同情，李自成就说他“君非甚暗”。历史往往是这样，不管他生前有多少可非议之处，而自杀可以算得上是“悲壮”、“惨烈”的死，都足以博得同情和好感。因为历来在亡国之际，少有君主“死社稷”的，于是，他被称颂，甚至连清朝皇帝顺治也对其认可，认为他是一个不可多得的皇帝，他之所以失败，就是因为用人不当。
但我们似乎忘了一件事，崇祯杀了魏忠贤，却在后期依旧重用宦官。而他重用宦官的结果是，宦官临出宫时在柱子上写道：此处不留爷，自有留爷处。
如果崇祯真是一个不可多得的明君，怎么会有如此混账的太监？他给了他们那么重的信任，换来的却是当了太监的孙子。
崇祯十七年（1644年）正月，他确信大势已去，但又不肯就这样把大明江山交给已经逼近北京的农民军。他找来大臣李明睿，问对策。
李明睿让他屏退左右，然后走到他面前，小声并郑重地说道：“如今之计，只有南迁，除此之外，别无他法。”
崇祯很颓唐，叹息一会道：“此事关系重大，怎可轻言。爱卿常读史书，难道忘了当初我祖先（英宗）被瓦剌劫持，又兵临京城，有人建议南下，结果被万人所唾骂。难道你想要我也被万民唾骂？”
李明睿笑了笑，不语。崇祯又道：“不知天意如何？”
李明睿道：“天命是与皇上站在一起的，请皇上不要犹豫，尽快决断。”
崇祯想了一想，轻声道：“其实我早就有南下之意，但朝中臣子无人附和，所以才到了这步田地。现在，你和我都有此意，但外边诸臣不从，该如何是好？此事重大，你要保守秘密，不可轻泄，否则，我诛你三族。”
李明睿明白，崇祯帝是担心外臣反对，而影响自己的“明君”之名。但到了该年的二月份，农民军已经逼近京师，并向他下了“最后通牒”。崇祯诏天下诸镇兵入援勤王，又命大臣们对战守事宜献计献策。愚蠢的崇祯不明白，各镇正在防守清军，一旦回师京城，就等于是把北方完全让给了满洲人。宁远总兵吴三桂并没有回京师，其他诸王见吴三桂未回，也跟着效仿起来。
大臣们各自献计献策，但在当时的情况下，任何计策都没有用，李明睿又向崇祯帝密陈南迁。都御史李邦华请崇祯下旨要太子先到南京，这样，南方就会以太子为天下之望，即使北京陷落，以太子在南京主事，必能卷土重来。
周皇后却认为田贵妃这是在想要对太子不利，因为从两个人所生孩子数量来看，是不相上下的。太子慈烺、怀隐王慈烜、定王慈炯是周皇后所生，而田贵妃生了永王慈炤、悼灵王慈焕、悼怀王及皇七子。后两个很早就死掉了。但她凭着这两个儿子也足以和周皇后的太子朱慈烺抗衡，后来诸多的朱三太子案就能证明这一点。
朱慈烺在太子岁月留下的资料跟他的下落一样，是个谜。可以说，没有任何一朝的太子像他这样留下这么少得可怜的资料。总是有一种感觉，这个太子是否真的存在过。因为在大明朝末期，人人注意的都是崇祯和李自成还有满人，一个并没有成为皇帝的太子朱慈烺，其分量真是太轻了。当时英雄太多，遂使他默默无闻。
皇太子案（1）
朱慈烺死后，事情并没有人们所想象的那样人死灯灭。在崇祯十七年（1644年）十二月，南明鸿胪寺少卿高梦箕的奴仆穆虎从北方南下，途中遇到一位少年，因此结伴而行。晚上就寝时，穆虎发现少年内衣织有龙纹，惊问其身份，少年自称是皇太子朱慈烺。
其时，朱由崧已经在南京建立弘光政权。得知此事后，便命令太监李继周将太子接到南京。据说，太子在见到李继周时曾问：“迎我进京，皇帝给我做吗？”
李继周摇头，“此事如何哪是我等奴婢所能知晓的！”
顺治二年，也就是公元1645年三月初一，太子来到南京，被交付锦衣卫冯可宗处看管。朱由崧派了两个太监去辨认真伪。两人一见到太子就抱头大哭，还脱下了衣服给太子穿上。朱由崧知道后，大怒，跟两个太监道：“真假未辨，你们就行见太子之礼，混账！”
说完，将两个太监拉了出去斩首，又将李继周也杀了。然后，面谕群臣道：“有一稚子言是先帝东宫，若是真先帝之子即朕之子，当抚养优恤，不令失所。”随令侯、伯、九卿、翰林、科、道等官同往审视。
原总督京营太监卢九德来到太子所居处，正视良久，不说一语。太子大怒，“卢九德，你见我怎不叩头？”
卢九德不由自主地跪下叩头，已经魂不附体。
太子骂道：“才一年不见，你居然肥胖如猪，可见在南京享福不浅啊。”
卢九德上下牙捉对似的厮打，又被太子骂了许久，才张皇而出。见到朱由崧后，回道：“有些相像，却认不真。”
朱由崧陷入了沉思，老实说，他这个皇帝之位来得不易。如果太子是真的，按照祖宗成法，他必须要把皇位让出去。虽然，南京百姓对他这个政权的所作所为已经痛不欲生，但就这样把皇位让出去，实在不情愿。
当南京百姓知道了太子之事后，纷纷要求太子登基称帝。明旧臣、处于长江中游的左良玉在这个时候以保护太子的名义进逼南京；长江以北的黄得功、刘良佐等总兵也上疏要求朱由崧善待太子。危机一触即发，朱由崧如同热锅上的蚂蚁，坐立不安。
他准备再让人辨认太子，而这一次的辨认却是抱着某种目的去的。事实上，朱由崧政权的许多官员都在崇祯朝廷上任职，大多数人都远远地见到过太子朱慈烺。曾经担任东宫讲官的刘正宗、李景廉“皆言太子眉长于目”，他们看了伪太子之后都说“认不清”；朱由崧认为，这是大臣们对自己不满，而刻意地不想认出太子来。
他找来亲信，对太子进行辨认。这些亲信在他的示意下一口咬定太子是假的。并对太子进行严刑拷问，审讯结果出来了：太子是假的，真名叫王之明。
既然王之明承认自己就是王之明了，那么，下面的审讯应该轻松多了，但事实却是，难度依旧，笑料百出。
审问官问道：王之明，你冒充太子该当何罪？
王之明：我既然被你们说成不是太子，也就罢了，何必要给我改姓名？
审问官：王之明。
王之明不回答。
审问官：为何不应？
王之明：何不喊“明之王”？
审问官大怒，吩咐用刑。
太子高呼：皇天啊上帝。
该年五月十日，清军大举南下，朱由崧到太平府避难。南京百姓这才冲进监狱，把奄奄一息的太子救了出来，并拥其登上皇位。这个皇位只持续了五天，五天后，清军大将多铎进入南京城。他第一件事就是问太子，有人告诉他，哪里有什么太子，是一个叫王之明的人冒充的。
多铎笑道：“你们真愚蠢，如果他承认自己是真太子，朱由崧早就把他杀了。”
一名降臣趁机说道：“是啊，太子本不承认自己是冒充的，都是马士英（一个太监）的安排。”
多铎连连点头，并骂道：“奸臣，奸臣。”
十天后，多铎设宴招待刚擒获的朱由崧，并将他的位置安排在皇太子之下。皇太子对朱由崧道：“你看，你让李继周把我叫来，又不认我，还给我改名，又让人抽打我。这些事，你知道不知道？”朱由崧坐在他下首，不作一语。几个月后，多铎将太子和朱由崧带到了北京，随后都被处死。
太子孙登——孙吴政权的遗恨
太子孙登——孙吴政权的遗恨
在太子之位的二十多年里，孙登上得孙权之欢心，下被天下百姓爱戴，中与朝中大臣和睦相处，其治理国家之能力，在大事小事上皆闪耀着一个明君之光芒。品德无二，能力无双。无论从哪一方面来看，他将来都是一位不可多得的明君。可想不到的是，他居然那么早地就离开了人世，离开了众望所归的那个皇帝之位。
二十一年太子，他留给了吴国上下无限的悲哀，他留给父亲的是一份宝贵的治国遗嘱。他走的时候才三十三岁，正是一个人可创造辉煌的时候。他的宅心仁厚在整个吴国尽人皆知，他死后被称为“宣太子”，他活着的时候，其仁义、其道德已经人人传颂。他的死是吴国的大损失，也是中国历史的损失。我们在感叹他英年早逝的同时，也应该感叹，历史只是因为一个太子的死而改变了它本不该改变的发展方向。
一份宝贵的政治遗嘱
公元241年，年仅三十三岁的吴国太子孙登病逝。他在临死前给父亲孙权留下了一份洋洋洒洒的千字文。
孩儿不孝不贤，所以被上天惩罚而缠上重病。自我反省，实在无话可说。品行鄙陋，恐怕终要离父亲而去了。我并不惋惜自己，只是一想到将离开父母，从此，人鬼殊途，永远也不能再敬奉仰望宫禁，不能朝拜陛下王后，生时没有为国家出一点力，死却留给陛下沉重的忧伤，这才是我感到悲哀的地方啊。
古人说，生死有命，长短在天。周晋、颜回都是智勇双全的人才，尚且夭折，更何况是我愚昧鄙陋，活到今天，已经是上苍对我不薄了。况且，我活着的时候是太子，死后还享受尊荣的地位，对于我来说，拥有的已经太多，我还有什么可悲叹遗憾的呢？如今天下大事还没有定局，流窜的贼寇还没有处置，四海翘首以待，把命运系在父亲您身上。处境危险的人希望安全，处境动乱的人更是希望太平。希望父亲能彻底忘掉我这个人，割舍普通百姓的情感，修炼黄老之术，专心保养精神，加进营养膳食，广开神圣英明的思虑，以确立万古不朽的功业，那么，整个天下的百姓很幸运地有了靠山，我死而无憾了。
父亲不必为我的死难过，皇子孙和仁义孝顺，聪明睿智，德行清明丰茂，应及早安排，从而